两者的区别在于定义不同，各自培养的目标不同，最终颁发的文凭不同。
专业学位是相对于学术类的学位，其目的是培养具有掌握扎实理论基础，并且能够在特殊特定的行业进行专业高层次的专门技术人员。
学术学位即普通学位，是单纯的学位名称，由学士学位、硕士学位和博士学位三个等级组成。
工程博士专业学位、教育博士专业学位、兽医博士专业学位、临床医学博士专业学位、口腔医学博士专业学位、职业法律博士专业学位
专业型博士，主要是为了满足特定社会职业的专业人才需求，如工程师、医师、教师等，主要着力于培养受教育者应用型开发性研究与设计能力；专业博士表征的主要是其获得者具备了特定社会职业所要求的专业能力和素养，具备了从业的基本条件，能够运用专业领域已有的理论、知识和技术有效地从事专业工作，合理地解决专业问题。
专业学位工程博士毕业后是可以申请海外博士后的。这是因为正规博士毕业后，申请海外博士后是可行，国内博士毕业后想要申请国外博士后需要满足一些条件,比如说有海外知名大学的博士学位、有相关领域的研究经验