是的，搜查令有可能会查银行卡。根据法律规定，当被执行人不履行法律文书确定的义务，并且隐匿财产时，人民法院有权发出搜查令，并对被执行人及其住所或者财产隐匿地进行搜查。
此外，如果当事人与被执行人共同生活且尚在一处居住，当事人可以在对方没有完全防备时，发现对方存折或银行卡，并将相关材料复印或号码抄下。然而，需要注意的是，如果没有确切的信息，如具体的开户行和账号，法院可能会表示拒绝查询。
搜查令适用于调查职务犯罪案件。
《中华人民共和国监察法》第二十四条规定：监察机关可以对涉嫌职务犯罪的被调查人以及可能隐藏被调查人或者犯罪证据的人的身体、物品、住处和其他有关地方进行搜查。在搜查时，应当出示搜查证，并有被搜查人或者其家属等见证人在场。搜查女性身体，应当由女性工作人员进行。监察机关进行搜查时，可以根据工作需要提请公安机关配合。