可以明确的回答：夫妻双方签的村里调解协议是有效的。这是因为：村委会是最基层的组织，只要签的协议是真实意思的表示，该调解协议就是有效的协议。
夫妻私下签订的协议有效，但要具备以下条件：
双方签订协议时意思表示真实；
协议的内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背社会的公序良俗、不损害他人合法利益；
协议的签订人有相应的民事行为能力。
如果夫妻双方的结婚证丢失了，可以前往当地的民政局进行补办。补办需要提供一些证明材料，例如：户口簿、身份证、结婚证明、现住址证明等。一般需要填写申请表并缴纳一定的费用。具体的补办流程和所需材料可能因不同地区而有所差异，建议前往当地民政局咨询或查阅相关政策规定。