可以申请办理。特殊门诊是指符合规定大病、慢性病，在门诊治疗也可以按照住院那种报销，因为医保都是只报销住院费用的，但是一些大病和慢病，不一定需要住院的，在门诊也可以做治疗的，所以才有特殊门诊了。
农保是可以转社保的。参保人员可以携带其身份证和农保卡等资料，去当地的社保经办机构申请办理社保登记，并将相应的农保转为社保，将其余额和缴费年限累计算在社保中。所谓农保转社保更多时候指的是：将居民养老保险转入社保中的职工养老保险。
一般情况下，农保和社保是可以一起交的，但是没有必要一起交。因为退休时只能使用其一，农保交费少同时收益也比较少，而社保交费较多且收益也较多。就算农保和社保一起交了，最后也不会多报销钱。