因互联网渠道和取票机以及人工窗口系统有差别，上述情况确实会存在；但列车一旦开出，便不能办理退票。现在这种情况己经以较稀少了。
因为铁路部门规定同一身份信息不可以购买同一时间同一车次一张以上车票，所以你的问题只有以下可能：
1：你同时买的是不同日期的火车票。
2：你同时买的同日不同车次的车票。
网上订票时同一身份证同一车次同一天订到两张票，这个应该是系统的问题，原则上不可以的。
12306铁路客服中心已经发布公告，自2014年的12月26日起，火车售票系统将不接受行程冲突的购票。如果旅客再次购票时被提示与前次购票行程冲突，已购车票必须办理改签或退票，然后才能重新购票。